Los rangos de misiones son utilizados en las Aldeas Ocultas para poder dividir las diferentes misiones que llegan a la misma por orden de dificultad y de este modo poder asignarlas a ninjas o grupos que posean las aptitudes necesarias para realizarlas. Los ninjas de diferentes rangos tienen la capacidad de realizar diferentes tipos de misiones como se muestra en el diagrama superior. Siendo las misiones más dificiles aquellas las de rango S, que no se muestran por ser misiones especiales, seguido por las de rango A hasta las de rango E. Mientras más alto el rango de la misión, más difícil resulta el poder completarlas, aumentando a su vez la peligrosidad de las mismas. Las características de los diferentes rangos están dadas por las siguientes especificaciones:

Misiones D - Estas son misiones de bajo nivel, que por lo general envuelve el realizar trabajos manuales y domésticos, que se llevan a cabo en la misma aldea del ninja. Suelen ser misiones aburridas que van desde rescatar animales perdidos hasta servir de niñera. Se requiere que un Genin alla realizado al menos 7 misiones de clase D antes de tomar el examen de Chunnin.

Misiones C - Son misiones que en su mayoría son dadas a ninjas de rango Chunnin y en otros casos a Genin, cuando estos se encuentran en grupos, por lo general liderados por un Jounin o Chunin experimentado. Estas misiones envuelven la protección de personas cuando no hay riesgo de que estas vayan a ser atacadas por ninjas de otras aldeas, o protección de documentos no muy importantes.

Misiones B - Para estas misiones se requiere como mínimo un nivel Chunnin, en su mayoría de algún Chunnin de alto nivel, bastante experimentado. Suelen ser misiones de protección, recuperación y recopilación de información o incluso el asesinato de algún criminal peligroso. Son misiones que también conllevan un nivel de peligrosidad alto dado que no siempre se conoce a los posibles enemigos que se puede encontrar, razón por la que se requiere tal nivel de ninjas para realizarlas.

Misiones A - Estas misiones requieren un alto grado de inteligencia y habilidad, así como nivel de pelea por parte de quien las realiza. Es por eso que son realizadas exclusivamente por ninjas de clase Jounin, considerados la elite de las Aldeas Ocultas. Estas misiones también presentan un alto nivel de peligrosidad y riesgo e incluyen en ocasiones la persecución o asesinato de criminales rango S.

Misiones S - Son misiones especiales de alta peligrosidad llevadas a cabo con poca frecuencia y que son realizadas solo por Kages y Jounin altamente preparados. Pueden incluir la casería de peligrosos criminales rango S.

Cabe decir que el rango de las misiones puede cambiar en cualquier momento mientras es realizada, cuando el nivel de peligrosidad de las mismas aumenta, en ocasiones por la aparición de uno o varios enemigos inesperados. Es por eso que un ninja de un nivel bajo puede verse obligado a participar en una misión de alto nivel. Todas las misiones realizadas son apuntadas en un libro especial que contiene los datos y perfiles de los diferentes ninjas.